核定位组学

核定位组学

▼服务简介

在大数据时代,南京瑞源生物通过科学实验验证组学结合新一代NGS测序技术,并利用生物信息学分析方法,综合整理浩瀚地组学信息,推出了酵母平台系统+NGS技术服务,将快速有效地推进系统生物学研究的进展。

iNTT系统可用于筛选新的核蛋白,研究核蛋白在生物和非生物胁迫下的动态组成,这类分析对于研究基因表达调控机制和分离治疗后的关键调控基因具有重要意义。本研究将改良的NTT系统与“后抑制减法”相结合,开发了一种新的核蛋白iNTT系统。在iNTT系统中,使用pLexAD载体来筛选cDNA文库,而不是以前在NTT系统中使用pLexAD-NES载体。在筛选NLS和GmAREB核蛋白时,iNTT系统比以往的NTT系统表现出更高的筛选效率。为了鉴定黑麦的耐温基因和温度响应基因。

▼实验原理

核蛋白筛选系统(NTT):在融合蛋白中加入核定位信号,融合蛋白可以进入酵母细胞核与LexA-BD的靶顺式作用元件结合,利用GAL4-AD的活性激活酵母下游报告基因表达,如果Leu2基因在酵母(EGY48)中表达,被转化的酵母就会在缺乏亮氨酸的培养基上生长。因此,利用这一原理,从cDNA文库中筛选带有核定位信号的编码核蛋白的基因。

▼酵母核定位高通量筛选系统

实验分类

实验技术

实验目的

核定位组学

酵母核定位高通量筛选系统

筛选带有核定位信号的编码核蛋白的基因

▼技术优势

本研究构建的以LexAD 为主要结构域的核蛋白筛选系统,不需要进行核总蛋白的纯化或标记,操作简便、筛选效率高,能够与下代测序技术NGS相结合,对于研究生物体核蛋白的动态组成,阐明细胞核内基因调控网络具有重要的理论意义。

南京瑞源生物将构建的核定位筛选系统与NGS技术结合用于大规模的核蛋白的表达分析。利用核蛋白筛选系统大量筛选编码核蛋白的基因,结合NGS测序技术及生物信息学分析核蛋白的表达谱,分析核蛋白的组成,实时监控各种植物核蛋白的构成及动态变化,为进一步研究植物细胞核内基因调控网络提供候选基因。

▼核定位组学实验案例

  

利用NTT系统筛选大豆重要抗逆基因及转DREB基因小麦抗逆性鉴定_吴学闯   西北农林

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