水稻OsERF103基因生物信息学分析、亚细胞定位及表达分析

中文标题:水稻OsERF103基因生物信息学分析、亚细胞定位及表达分析

文章作者:邹杰 李生强 刘显军 陈刚

发表单位:宜春学院 生命科学与资源环境学院/江西省作物生长发育调控重点实验室

发表期刊: 农 业 生 物 技 术 学 报


文献点击下载


研究背景:

乙烯应答因子(ethylene responsive factors, ERFs)是一类植物特有的转录因子,在植物的生长发育和逆境胁迫响应中起重要调控作用。为了研究水稻(Oryza sativa) OsERF103 基因(GenBank No. XM_015768788)的功能,本研究利用生物信息学方法对其序列特征进行分析;构建了pBWA(V)HS-OsERF103-Glosgfp融合表达载体并转化水稻原生质体,通过激光共聚焦显微镜观察融合蛋白在水稻原生质体的亚细胞定位;利用qRT-PCR技术对该基因在水稻不同组织及不同逆境胁迫下的表达模式进行分析。结果表明 OsERF103含有 1个 AP2 (APETALA2)结构域,为亲水性蛋白,不含信号肽和跨膜结构,在进化关系上与短舌野生稻(Oryza brachyantha)类脱落酸阻遏因(abscisic acid repressor 1-like, ABR1-like)蛋白的亲缘关系最近;亚细胞定位结果显示OsERF103定位于细胞核;qRT-PCR分析结果显示,OsERF103在孕穗期的根、茎、叶、叶鞘、叶枕和幼穗中均有表达,其在根中表达最强,在叶和幼穗中表达较弱;OsERF103被高温、低温、PEG6000、高盐和脱落酸(abscisic acid, ABA)诱导表达,但在不同的胁迫条件下该基因表达模式不尽相同。本研究为进一步研究水稻OsERF103基因的功能提供了基础资料。

主要研究结果:

原生质体亚细胞定位

研究结论:

本研究中,OsERF103呈组成性表达,但在根中表达最强烈,与OsERF62/OsRAF/OsLG3的表达特征一致。过表达OsLG3可提高水稻的耐旱性,为今后的研究提供了一个参考方向本研究对水稻OsERF103基因(GenBankNo.XM_015768788)进行了生物信息学分析,对其进行植物亚细胞定位观察,并分析了其组织表达特征和非生物胁迫表达特征。结果表明,OsERF103是典型的ERF蛋白,定位于细胞核中;OsERF103根、茎和叶枕中表达较强,并受多种非生物胁迫因素和ABA诱导。本研究为进一步研究水稻OsERF103基因的功能提供了基础资料。

 

小编有话说:

综上,ERFs是一类含1个AP2结构域的AP2/ERF转录因子家族。ERFs转录因子主要定位于细胞核,在细胞核中参与转录调控过程不同的ERFs基因其组织表达模式也存在差异。OsERF1在水稻不同器官中呈组成性表达。

本研究的技术路线值得借鉴,感兴趣的读者可以主动下载阅读。

 

水稻OsERF103基因生物信息学分析、亚细胞定位及表达分析
本研究中,Os⁃ERF103呈组成性表达,但在根中表达最强烈,与OsERF62/OsRAF/OsLG3的表达特征一致。过表达OsLG3可提高水稻的耐旱性,为今后的研究提供了一个参考方向本研究对水稻OsERF103基因(GenBankNo.XM_015768788)进行了生物信息学分析,对其进行植物亚细胞定位观察,并分析了其组织表达特征和非生物胁迫表达特征。结果表明,OsERF103是典型的ERF蛋
长按图片保存/分享

友情推荐:南京维百瑞理化激素检测服务公司

图片展示

电话:400-863-8520;025-5767-5161

邮箱:order@bestofbest.top

地址:南京市栖霞区江苏生命科技园F7栋

科研快递订阅

  • 名字 *

  • 邮箱 *

  • 电话

  • 机构 *

  • 提交

  • 验证码
    看不清?换一张
    取消
    确定

咨询留言

  • 姓名 *

  • 电话 *

  • 留言 *

  • 提交

  • 验证码
    看不清?换一张
    取消
    确定

Copyright © 南京瑞源生物技术有限公司 版权所有      苏ICP备20003978号

Copyright © 瑞源生物

苏ICP备20003978号

联系电话
400-8638520
联系电话
025-57671761
二维码