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高通量互作组学文库 免费构建

作者:南京瑞源生物技术有限公司 浏览: 发表时间:2021-08-05 15:11:26

蛋白互作

蛋白质是生命活动的主要承担者,研究与之相互作用的蛋白网络,从而阐释生理过程至关重要,通常会通过网站预测或者阅读大量的文献去查阅可能与目标蛋白相互作用的蛋白质B、C、D、F,为了保险起见,通过酵母双杂交实验进行一一验证,如果不对只能这样周而复始,这样猜测般的寻找会浪费很多的时间,且一个实验只能验证一对一的互作,就算一次可以做和多个平行实验,那也是十分耗费资源与精力。(文末有彩蛋哦~


有没有一种方法可以一次性筛选到所有与之互作的蛋白质呢?

答案是有的----构建该物种的酵母文库


酵母文库构建

我们将该物种的所有RNA提取出来,然后将将mRNA与之分离,通过逆转录获得其CDNA,将其整合好的CDNA构建到AD载体上,这样我们就有了该物种表达的所有基因,我们只需要将自己研究的基因构建到BD载体上,然后进行一次酵母文库筛选实验就可以筛选到与目的蛋白互作的所有蛋白质,而不用一个一个的去猜去预测,这样可以省下很多的时间以及资源。

NGS测序

在大数据时代,南京瑞源生物寻求技术突破,终于通过科学实验验证组学结合新一代NGS测序技术,并利用生物信息学分析方法,综合整理浩瀚的组学信息,推出了酵母平台系统+NGS技术服务,将快速有效地推进系统生物学研究的进展。

瑞源生物利用升级后的Y2H-Seq技术(瑞源生物|组学+酵母双杂交联合实验策略 ——interactome(互作组学)筛选水稻cDNA文库,得到了1000+条NGS数据库,经过冗余去重后发现有900多个互作的蛋白,并对这900多个互作的蛋白进行蛋白注释,分析发现有67个与目的蛋白互作的TF及激酶,大大提高了互作蛋白筛选的范围。


同时我们与传统的Y2H进行了平行验证,采用一代测序,将一代测序与NGS测序对比分析,并进行功能注释,发现仅有一个TF,且与NGS测序的结果高度重合。

结果表明Y2H-Seq将真正意义上的替代传统的Y2H工作。


one week  one  library

同物种文库的一次构建可以多人多次进行使用,这样省下来的时间和资源是无法估算的。南京瑞源公司对于建库进行严格把关,高质量的cDNA是获得平均长度更长以及全长率更高的保证,其次是酵母文库的库容大小,基因覆盖率越大筛库工作越容易进行,为感谢客户对瑞源生物的支持,推出“one week  one library “活动,如果有目的蛋白需要我们来筛库,我们免费为您构建高通量互作组学文库,生物物种不限,仅限10个名额。


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高通量互作组学文库 免费构建
为感谢客户对瑞源生物的支持,推出“one week one library “活动,如果有目的蛋白需要我们来筛库,我们免费为您构建高通量互作组学文库,生物物种不限,仅限10个名额。
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