逆境组学

逆境组学

▼服务简介

在大数据时代,南京瑞源生物通过科学实验验证组学结合新一代NGS测序技术,并利用生物信息学分析方法,综合整理浩瀚地组学信息,推出了酵母平台系统+NGS技术服务,将快速有效地推进系统生物学研究的进展。

当植物受到逆境胁迫时通过细胞信号转导引起基因表达调控,导致大量蛋白质表达变化,从蛋白质水平研究植物适应逆境胁迫的分子机理具有重要意义。逆境组学研究一方面采用新兴的靶向蛋白质组学对目标蛋白进行精准定量和蛋白质复合体鉴定,更加深入地阐明重要蛋白质的功能与结构;另一方面,与遗传学、生物化学、基因组学、转录组学和代谢组等技术相结合深度挖掘重要代谢通路,进一步完善生物生命活动的信号调控网络,为生物资源的保护与利用、培育高抗高产的新品种提供更加准确的参考。

▼实验原理

逆境组学原理

利用酵母菌,在逆境胁迫下的差异蛋白表达模式,检测酵母菌表达可溶性蛋白是否可以帮助酵母菌度过逆境胁迫。通过抗性梯度实验结合NGS测序技术对基因组范围内的抗性相关基因进行筛查,并对筛查的结果进行生物信息学分析,将这些抗逆基因进行归纳、分类。

▼酵母逆境基因高通量筛选

实验分类

实验技术

实验目的

逆境组学

酵母逆境基因高通量筛选

筛选参与逆境胁迫蛋白的基因

▼逆境组学科研方案

▼参考文献

参考文献:Revealing the salt tolerance mechanism of Tamarix hispida by large-scale identication of genes conferring salt tolerance.

作者Zhibo Wang, Zihang He, Xin Xu, Xinxin Shi, Xiaoyu Ji and Yucheng Wang.

文献链接:https://doi.org/10.1093/treephys/tpab072

期刊:Tree Physiology. 20 May 2021

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