瑞源生物-拟南芥TF文库

数字化模拟文库

▼ 技术简介

南京瑞源生物开发了多个全面涵盖不同物种转录因子(TF)的数字化模拟文库,适用于数字化筛选技术。

数字化筛库是一种利用计算机进行高通量文库筛选的方法,可以快速、高效、全面地发现与特定蛋白互作的基因。

▼产品规格

▼ 文库物种

物种

拉丁名

TF数量

大豆

glycine max

6150

大麦

Hordeum vulgare

2620

番茄

Solanum lycopersicum

1845

马铃薯

Solanum tuberosum

2405

毛果杨

Populus trichocarpa

4224

陆地棉

Gossypium hirsutum

5022

木薯

Manihot esculenta

2676

苹果

Malus domestica

3119

小麦

Triticum aestivum

3606

玉米

Zea mays

3308

油菜

Brassica napus

5985

甜瓜

Cucumis melo

1537

草莓

Fragaria x ananassa

1247

Prunus persica

2780

猕猴桃

Actinidia chinensis

2296

花生

Arachis hypogaea

799

甘蓝

Brassica oleracea

4272

白菜

Brassica rapa

4127


物种

拉丁名

全基因

拟南芥

Arabidopsis thaliana

27434

大豆

Glycine max

55799

水稻

Oryza sativa

43649

玉米

Zea mays

39299

Homo sapiens

23391

黑腹果蝇

Drosophila melanogaster

13458

小鼠

Mus musculus

21615

大鼠

Rattus norvegicus

21270

斑马鱼

Danio rerio

24664

秀丽隐杆线虫

Caenorhabditis elegans

19694

酿酒酵母

Saccharomyces cerevisiae

6039

裂殖酵母

Schizosaccharomyces pombe

5128

白色念珠菌

Candida albicans

5974

詹氏甲烷球菌

Methanocaldococcus jannaschii

1773

大肠杆菌

Escherichia coli

4363

盘基网柄菌

Dictyostelium discoideum

12622


物种

拉丁名

全基因

荚膜组织胞浆菌

Ajellomyces capsulatus

9199

马来丝虫

Brugia malayi

8743

空肠弯曲杆菌

Campylobacter jejuni

1620

卡氏棒虫

Cladophialophora carrionii

11170

麦地那龙线虫

Dracunculus medinensis

10834

肠球菌

Enterococcus faecium

2823

佩德罗索氏产色芽生菌

Fonsecaea pedrosoi

12509

流感嗜血杆菌

Haemophilus influenzae

1662

幽门螺杆菌

Helicobacter pylori

1538

肺炎克雷伯氏菌

Klebsiella pneumoniae

5727

婴儿利什曼原虫

Leishmania infantum

7924

足马杜拉分枝菌

Madurella mycetomatis

9561

麻风分枝杆菌

Mycobacterium leprae

1602

结核分枝杆菌

Mycobacterium tuberculosis

3988

溃疡分枝杆菌

Mycobacterium ulcerans

9033

淋病奈瑟菌

Neisseria gonorrhoeae

2106

巴西诺卡氏菌

Nocardia brasiliensis

8372

盘尾丝虫

Onchocerca volvulus

12047

卢氏副球菌

Paracoccidioides lutzii

8794

恶性疟原虫

Plasmodium falciparum

5187

铜绿假单胞菌

Pseudomonas aeruginosa

5556

鼠伤寒沙门菌

Salmonella typhimurium

4526

曼氏血吸虫

Schistosoma mansoni

13865

痢疾志贺菌

Shigella dysenteriae

3893

申克氏孢子丝菌

Sporothrix schenckii

8652

金黄色葡萄球菌

Staphylococcus aureus

2888

肺炎链球菌

Streptococcus pneumoniae

2030

粪类圆线虫

Strongyloides stercoralis

12613

鞭虫

Trichuris trichiura

9564

布氏锥虫

Trypanosoma brucei

8491

克氏锥虫

Trypanosoma cruzi

19036

班氏丝虫

Wuchereria bancrofti

12721


▼ 技术优势

零实验操作与试剂费用:我们的AI系统为您提供全自动服务,省去实验繁琐的操作和昂贵的试剂耗材开支。

快速候选基因筛选:14天内获得酵母杂交实验结果,让您告别长达3-4个月的等待时间。

可信赖的结果:我们的AI筛选结果已通过实验验证,AI筛选结果涵盖实验操作结果。

成本低:价格仅相当于传统实验的1/3。

可靠的置信度分析:这将大大缩小互作蛋白或基因验证的范围,让您避免不必要的工作。

蛋白质互作核心位点分析:提供高清晰度的3D蛋白结构分析图,满足不同期刊格式要求。


▼ 服务流程

客户提供氨基酸序列或CDS全长序列---数字三维模拟建库---高通量数字模拟筛库

 

▼ 交付案例

数字建库

全数据三维建模评分表;三维建模PDB压缩包



数字筛库

全数据分子对接评分表格(如图);5对一对一精准分析(含三维结构建模以及核心作用位点分析)


项目示意图

 

▼技术支持

本公司产品使用过程中如有任何疑问与建议,欢迎随时与我们联系:market@bestofbest.top

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